Aquellos que se presentan en la motilidad que ralentizan los intestinos, como síndrome de intestino irritable (SII), diabetes y esclerodermia.
En algunos casos el estómago e intestino delgado no digieren completamente algunos nutrientes, como por ejemplo los carbohidratos, azúcares, almidones y fibra, de los alimentos que consume. Esto es lo que se conoce como intolerancias alimenticias.